Peran Mikroba Enzim dalam Bioremediasi Polutan
Kualitas kehidupan di bumi ini sangat
terkait erat dengan keseluruhan kualitas pada lingkungan. Sayangnya kemajuan di
bidang ilmu pengetahuan, teknologi, dan industri dalam jumlah yang
besar, yaitu pembuangan limbah nuklir
yang dibuang pada suatu ekosistem
akibatnya bisa menimbulkan masalah serius bagi kelangsungan hidup umat manusia di bumi.
Di masa lalu, limbah secara
tradisional dibuang dengan
menggali lubang dan mengisinya
dengan bahan limbah. Ini modus pembuangan limbah itu di FFI kultus untuk mempertahankan karena kurangnya tempat baru setiap kali untuk membuang. Teknologi baru untuk pembuangan
adalah cara pembuangan yang menggunakan insinerasi suhu tinggi dan dekomposisi
kimia (misalnya, basis-dikatalisasi deklorinasinya, oksidasi UV) telah
berevolusi. Meskipun mereka bisa
sangat effektive untuk mengurangi
lebar berbagai kontaminan
tetapi pada saat yang sama memiliki beberapa kelemahan. Metode ini sangat kompleks, tidak ekonomis, dan kekurangan
penerimaan publik. Terkait defisiensi dalam metode
ini telah memfokuskan upaya
menuju pemanfaatan modernisasi
proses bioremediasi hari sebagai alternatif
yang sesuai.
Bioremediasi merupakan transformasi mikroorganisme
dimediasi atau degradasi
kontaminan menjadi zat tidak berbahaya atau kurang berbahaya. Mempekerjakan berbagai organisme seperti bakteri, jamur, ganggang, dan
tanaman untuk bioremediasi efisien
polutan telah dilaporkan [1, 2]. Keterlibatan
tanaman di bioremediasi polutan disebut s phytore mediation.
proses phytore mediasi
merupakan teknologi hijau baru yang memfasilitasi pemindahan atau degradasi bahan kimia beracun dalam tanah, sedimen, tanah,
air permukaan, dan udara (RTDF) . Secara genetik,
tanaman direkayasa juga digunakan. Misalnya
arsenik phytoremediated oleh genetik dimodifikasi
tanaman seperti Arabidopsis
thaliana yang mengungkapkan
dua gen bakteri. Salah
satu gen ini memungkinkan tanaman untuk memodifikasi arsenat menjadi arsenit
dan yang kedua mengikat dimodifikasi arsenit dan
menyimpannya di vakuola [2].
Proses bioremediasi terutama tergantung pada mikroorganisme yang secara
enzimatik menyerang polutan
dan mengkonversikannya ke produk berbahaya. Sebagai
bioremediasi yang efektif yaitu apabila kondisi lingkungan memungkinkan pertumbuhan dan aktivitas mikroba, penerapannya sering melibatkan manipulasi parameter lingkungan untuk memungkinkan pertumbuhan mikroba dan degradasi untuk melanjutkan pada tingkat yang lebih cepat (Gambar 1).
Proses bioremediasi adalah proses yang sangat lambat. Hanya beberapa
spesies bakteri dan jamur telah
terbukti 2 Enzim
Penelitian jamur tanaman
hijau bumi bakteri
Gambar 1: Proses limbah bioremediasi.
kemampuan mereka sebagai degraders pencemar potensial. Banyak turunan yang diketahui efektif sebagai agen bioremediasi tetapi hanya dalam kondisi laboratorium. Keterbatasan pertumbuhan bakteri berada di bawah pengaruh pH, suhu, oksigen, struktur tanah, kelembaban dan tingkat yang tepat nutrisi, bioavailabilitas, dan kehadiran senyawa beracun lainnya. Meskipun mikroorganisme bisa eksis dalam lingkungan yang ekstrim, kebanyakan dari mereka lebih memilih kondisi optimal situasi yang sulit dicapai di luar laboratorium [1, 3-5]. Kebanyakan sistem bioremediasi beroperasi di bawah kondisi aerob, tetapi lingkungan anaerobik juga dapat mengizinkan degradasi mikroba molekul . Kedua bakteri dan jamur bergantung pada partisipasi berbagai enzim intraseluler dan ekstraseluler masing-masing untuk remediasi bandel dan lignin dan organo polutan [1, 6].
Gambar 1: Proses limbah bioremediasi.
kemampuan mereka sebagai degraders pencemar potensial. Banyak turunan yang diketahui efektif sebagai agen bioremediasi tetapi hanya dalam kondisi laboratorium. Keterbatasan pertumbuhan bakteri berada di bawah pengaruh pH, suhu, oksigen, struktur tanah, kelembaban dan tingkat yang tepat nutrisi, bioavailabilitas, dan kehadiran senyawa beracun lainnya. Meskipun mikroorganisme bisa eksis dalam lingkungan yang ekstrim, kebanyakan dari mereka lebih memilih kondisi optimal situasi yang sulit dicapai di luar laboratorium [1, 3-5]. Kebanyakan sistem bioremediasi beroperasi di bawah kondisi aerob, tetapi lingkungan anaerobik juga dapat mengizinkan degradasi mikroba molekul . Kedua bakteri dan jamur bergantung pada partisipasi berbagai enzim intraseluler dan ekstraseluler masing-masing untuk remediasi bandel dan lignin dan organo polutan [1, 6].
sion (E.C.) nomor. Penetapan
nomor EC dijelaskan
dalam pedoman yang ditetapkan oleh
International Union of Biochemistry. Semua enzim
yang dikenal jatuh ke salah satu
dari enam kategori. Enam divisi utama adalah (1)
oksidoreduktase, (2) transferase, (3) hidrolisis,
(4) lyases, (5)
isomerase, dan (6)
ligases (sintetase). Oxidoreductase mengkatalisis elektron dan proton mentransfer
dari donor ke
akseptor. Transferase mengkatalisis transfer gugus fungsional dari donor ke
akseptor. Hidrolase memfasilitasi pembelahan C-C, C-O, C-N, dan obligasi lain dengan air. Lyases mengkatalisis
pembelahan ini obligasi
sama dengan eliminasi,
meninggalkan ikatan ganda (atau, dalam modus terbalik, mengkatalisis
penambahan kelompok di seluruh ikatan ganda). Isomerase memfasilitasi penyusunan ulang geometris atau struktural atau isomerizations. Akhirnya, ligases mengkatalisis
bergabung dari dua
molekul [7].
2.Enzim
2.1. Pengantar Enzim. Enzim adalah katalis biologis yang memfasilitasi konversi substrat menjadi produk dengan memberikan kondisi yang menguntungkan yang menurunkan energi aktivasi reaksi. Sebuah enzim mungkin protein atau glikoprotein dan terdiri dari setidaknya satu polipeptida bagian. Daerah enzim yang terlibat langsung dalam proses katalitik disebut situs aktif. Sebuah enzim mungkin memiliki satu atau lebih kelompok yang penting untuk aktivitas katalitik yang terkait dengan situs aktif baik melalui kovalen atau obligasi noncovalent; protein atau glikoprotein bagian dalam enzim seperti disebut apoenzyme, sedangkan bagian nonprotein disebut kelompok prostetik. Kombinasi dari apoenzyme dengan kelompok prostetik menghasilkan holoenzyme tersebut.
2.1. Pengantar Enzim. Enzim adalah katalis biologis yang memfasilitasi konversi substrat menjadi produk dengan memberikan kondisi yang menguntungkan yang menurunkan energi aktivasi reaksi. Sebuah enzim mungkin protein atau glikoprotein dan terdiri dari setidaknya satu polipeptida bagian. Daerah enzim yang terlibat langsung dalam proses katalitik disebut situs aktif. Sebuah enzim mungkin memiliki satu atau lebih kelompok yang penting untuk aktivitas katalitik yang terkait dengan situs aktif baik melalui kovalen atau obligasi noncovalent; protein atau glikoprotein bagian dalam enzim seperti disebut apoenzyme, sedangkan bagian nonprotein disebut kelompok prostetik. Kombinasi dari apoenzyme dengan kelompok prostetik menghasilkan holoenzyme tersebut.
2.2. Enzim Nomenklatur. Nama enzim
berlaku untuk katalitik tunggal, daripada
serangkaian reaksi dikatalisis secara individual. Nama terkait dengan fungsi enzim,
khususnya, untuk jenis reaksi yang dikatalisis [7].
2.3. Enzim Klasifikasi. Yang paling identifikasi enzim tertentu
dimungkinkan melalui enzim yang komisi.
3. Mikroba Enzim dalam Bioremediasi
3.1. Mikroba Oxidoreductase. The detoxifikasi adalah senyawa organik yang beracun oleh berbagai bakteri, jamur [9] dan tanaman yang lebih tinggi [10] melalui kopling oksidatif dimediasi dengan oksidoreduktase. Mikroba mengekstrak energi melalui energi menghasilkan reaksi biokimia dimediasi oleh enzim ini untuk membelah ikatan kimia dan untuk membantu transfer elektron dari substrat organik berkurang (donor) ke yang lain senyawa ical Kimia (akseptor). Selama reaksi oksidasi-reduksi tersebut, kontaminan yang akhirnya teroksidasi menjadi tak merugikan senyawa (ITRC 2002).
3.1. Mikroba Oxidoreductase. The detoxifikasi adalah senyawa organik yang beracun oleh berbagai bakteri, jamur [9] dan tanaman yang lebih tinggi [10] melalui kopling oksidatif dimediasi dengan oksidoreduktase. Mikroba mengekstrak energi melalui energi menghasilkan reaksi biokimia dimediasi oleh enzim ini untuk membelah ikatan kimia dan untuk membantu transfer elektron dari substrat organik berkurang (donor) ke yang lain senyawa ical Kimia (akseptor). Selama reaksi oksidasi-reduksi tersebut, kontaminan yang akhirnya teroksidasi menjadi tak merugikan senyawa (ITRC 2002).
Para oksidoreduktase berpartisipasi dalam Humifikasi berbagai zat fenolik yang
dihasilkan dari dekomposisi lignin dalam lingkungan tanah. Dengan cara yang sama, oksidoreduktase memindai juga oxicxenobiotics detoxifyt,
seperti fenolik atau
senyawa anilinic, melalui polimerisasi,
kopolimerisasi dengan substrat lain, atau mengikat
zat humat [11].
Enzim mikroba telah
dimanfaatkan dalam dekolorisasi dan degradasi
azodyes [1, 12,
13].
Banyak
bakteri mengurangi
logam radioaktif dari bentuk larut teroksidasi
menjadi bentuk larut berkurang. Selama proses produksi energi, bakteri mengambil elektron dari senyawa organik andUse
logam radioaktif sebagai
akhirnya akseptor elektron. Beberapa spesies
bakteri mengurangi logam radioaktif secara
tidak langsung dengan bantuan donor
elektron menengah. Akhirnya
tergesa-gesa dapat dilihat sebagai
hasil dari reaksi redoks dalam bakteri
logam-mengurangi [2].
Senyawa
fenolik yang diklorinasi yaitu salah satu limbah yang paling banyak ditemukan di effuents yang
dihasilkan oleh industri kertas. Senyawa
ini diproduksi pada degradasi parsial lignin
selama proses pemutihan bubur kertas. Banyak spesies jamur yang dianggap
cocok untuk menghilangkan senyawa
fenolik chlorinated dari lingkungan yang
terkontaminasi. Kegiatan jamur
terutama karena aksi enzim oksidoreduktase ekstraseluler,
seperti lakase, peroksidase
mangan, dan lignin
peroksidase, yang dibebaskan dari miselium jamur ke lingkungan terdekat
mereka. Menjadi fi
lamentous, jamur dapat
mencapai polutan tanah
lebih efektif daripada bakteri [14
Air
yang tercemar dengan senyawa fenolik
dapat didekontaminasi oleh tanaman dengan bantuan enzim memancarkan oleh
akar mereka. Pabrik keluarga Fabaceae, Gramineae,
dan Solanaceae ditemukan
untuk melepaskan oksidoreduktase yang mengambil bagian dalam degradasi oksidatif konstituen
tanah tertentu. Fitoremediasi
kontaminan organik telah Ini pada umumnya difokuskan
pada tiga kelas senyawa: pelarut diklorinasi, bahan
peledak, dan hidrokarbon minyak
bumi [15, 16].].
3.1.1. Mikroba oksigenase.
Oksigenase termasuk dalam kelompok
oksidoreduktase enzim. Mereka berpartisipasi dalam oksidasi berkurang substrat
dengan mentransfer oksigen dari molekul oksigen (O2) memanfaatkan
FAD / NADH
/ NADPH sebagai
kosubstrat. Oksigenase dikelompokkan menjadi dua kategori yang monooxygenases dan
oksigease berdasarkan jumlah atom oksigen yang
digunakan untuk oksigenasi.
Mereka memainkan peran
penting dalam metabolisme senyawa
organik dengan meningkatkan reaktivitas atau kelarutan
air atau membawa tentang
pembelahan cincin aromatik. Oksigenase memiliki
berbagai substrat yang luas
dan aktif terhadap berbagai senyawa, termasuk
aliphatic diklorinasi. Umumnya pengenalan atom
O2 ke dalam molekul
organik dengan hasil oxygenase di pembelahan
cincin aromatik. Secara
historis, enzim yang paling
banyak dipelajari dalam bioremediasi
adalah mono bakteri
atau oksigease. Sebuah studi rinci tentang peran oxygenases dalam proses biodegradasi tersedia [18-20]
Senyawa
organik terhalogenasi
terdiri dari kelompok terbesar dari polusi
lingkungan akibat digunakan
secara luas sebagai herbisida,
insektisida, fungisida, hidrolik dan perpindahan panas fluida, plastik, dan
intermediet untuk sintesis kimia.
Degradasi polutan ini dicapai dengan spesifik oksigenase. Oksigenase juga
memediasi reaksi dehalogenation
dari metana terhalogenasi,
etana, dan ethylenes
berkaitan dengan enzim multifungsi [19].
3.1.2. Monooxygenases. Monooxygenases
menggabungkan satu atom molekul oksigen ke dalam
substrat. Genases Monooxy-
yang diklasifikasikan menjadi dua subclass berdasarkan
kofaktor kehadiran: monooxygenases fl avindependent
dan P450 monooxygenases.monooxygenases Flavindependent mengandung fl avin sebagai gugus
prostetik dan memerlukan NADP atau NADPH sebagai koenzim. P 450 monooxygenases
yang heme- mengandung oksigenase yang ada di kedua organisme eukariotik dan
prokaryrotic. Para monooxygenases terdiri superfamili serbaguna enzim yang
mengkatalisis reaksi oksidatif substrat mulai dari alkana molekul endogen
kompleks seperti steroid dan asam lemak. Monooxygenases bertindak sebagai
biocatalysts dalam bioremediasi process dan kimia sintetik karena selektivitas
yang sangat daerah dan stereoselektivitas pada berbagai substrat. Mayoritas
mono-oksigenase dipelajari sebelumnya yang memiliki kofaktor, tetapi ada
monooxygenases tertentu yang fungsi tion independen kofaktor. Enzim ini
membutuhkan oksigen hanya molekul untuk kegiatan mereka dan memanfaatkan
substrat sebagai pereduksi [8, 22].
Desulfurisasi, dehalogenation, denitrifikasi, Amon fi
kasi, hidroksilasi, biotransformasi,
dan degradasi bio berbagai senyawa aromatik
dan alifatik yang
dikatalisasi oleh monooxygenases.
Properti ini telah dieksplorasi dalam beberapa tahun terakhir untuk aplikasi
penting dalam biodegradasi dan biotransformasi senyawa
aromatik [8]. Enzim
Methane monooxygenase adalah dicirikan satu
yang terbaik, antara monooxygenases. Enzim ini terlibat dalam degradasi hidrokarbon seperti substi-
tuted metana, alkana,
sikloalkana, alkena, haloalkenes, eter, dan
aromatik dan heterosiklik hidrokarbon [23, 24]
(Gambar 2). Dalam
kondisi yang kaya oksigen, mono-oksigenase mengkatalisis reaksi dehalogenation oksidatif,
sedangkan di bawah kadar oksigen rendah, deklorinasinya
reduktif terjadi. Oksidasi substrat dapat
menyebabkan dehalogenation sebagai
akibat dari pembentukan produk
labil yang mengalami dekomposisi kimia berikutnya
[19, 25, 26].
3.1.3. Mikroba oksigease.
Oksigease adalah sistem enzim ponent Multicom
yang memperkenalkan molekul oksigen
ke dalam substrat mereka. Oksigease hidrokarbon
aromatik, milik keluarga
besar Rieske oxygenases besi non-heme. Oksigease
ini mengkatalisis fi enantiospeci Cally
oksigenasi berbagai substrat. Oksigease terutama mengoksidasi
senyawa aromatik dan, oleh karena itu, memiliki aplikasi dalam
rehabilitasi lingkungan. Semua anggota keluarga ini memiliki
satu atau dua protein transpor elektron sebelumnya komponen oxygenase
mereka. Struktur kristal naftalena dioksigenase memiliki
kehadiran Rieske (2Fe-2S) klaster dan besi
mononuklear di setiap subunit alpha [4].
Oksigenase katekol berfungsi
sebagai bagian dari strategi alam
untuk merendahkan molekul aromatik di Lingkungan.
Mereka ditemukan dalam bakteri tanah dan terlibat
dalam transformasi prekursor
aromatik menjadi produk alifatik. The intradiol
membelah enzim memanfaatkan
Fe (III), sedangkan extradiol yang membelah
enzim memanfaatkan Fe (II) dan Mn (II) dalam beberapa
kasus [17] (Gambar
3).
3.2. Mikroba laccasa.
Laccasa (pdiphenol: dioksigen oksidoreduktase) merupakan keluarga oksidase
multicopper yang dihasilkan oleh tanaman tertentu, jamur, serangga, dan bakteri, yang
mengkatalisis oksidasi berbagai
berkurang fenolik dan substrat aromatik dengan
pengurangan seiring molekul oksigen ke dalam air [9, 29]. Laccasa
diketahui terjadi dalam berbagai bentuk isoenzim yang
masing-masing dikodekan oleh
gen terpisah [30],
dan dalam beberapa kasus, gen telah
dinyatakan secara berbeda tergantung
pada sifat dari inducer [31].
Banyak mikroorganisme menghasilkan
laccasa intra dan
ekstraseluler mampu mengkatalis oksidasi, Aminophenol, polifenol,
poliamina, lignin, dan diamina aril
serta beberapa ion anorganik [29,32,33] .Laccases
tidak hanya mengoksidasi asam phenolicand methoxyphenolic
(Gambar 4) , tetapi
juga mengalami dekarboksilasi mereka
dan menyerang kelompok metoksi mereka (demethylation).
Enzim ini terlibat dalam depolimerisasi lignin, yang
menghasilkan berbagai fenol.
Selain itu, senyawa ini digunakan sebagai nutrisi untuk mikroorganisme atau
repolymerized bahan humat oleh laccase
[34]. Di antara agen
biologis, laccasa mewakili kelompok yang menarik dari mana-mana, enzim
oksidoreduktase yang menunjukkan janji menawarkan potensi
besar untuk bioteknologi dan
bioremediasi aplikasi [9].
substrat spesifik dan
afinitas lakase dapat
bervariasi dengan perubahan
pH. Lakase dapat
dihambat oleh berbagai reagen
seperti halida (termasuk iodida), azida, sianida,
dan hidroksida [35].
Laccasa yang berbeda tampaknya memiliki berbeda toleransi terhadap penghambatan oleh halida,-individu cating
diferensial aksesibilitas halida. Produksi lakase sensitif terhadap konsentrasi nitrogen dalam jamur.
Tingkat nitrogen yang tinggi biasanya diperlukan ingreateramounts toobta lakase. Lakase
rekombinan dapat diproduksi oleh salah satu homolog atau heterolog cara
[9].
3.3. Peroksidasa mikroba.
Peroksidase (donor: oksidoreduktase hidrogen peroksida) adalah enzim-enzim di mana-mana yang mengkatalisis oksidasi lignin dan senyawa fenolik
lainnya
dengan mengorbankan hidrogen peroksida (H2O2) dengan adanya mediator. Peroksidase ini bisa protein hem dan nonhaem. Pada mamalia, mereka yang terlibat dalam proses biologis seperti sistem kekebalan tubuh atau peraturan hormon. Pada tumbuhan, mereka terlibat dalam auksin metabolisme, lignin dan suberin formasi, silang komponen dinding sel, pertahanan terhadap patogen, atau sel elongasi [37, 38].
dengan mengorbankan hidrogen peroksida (H2O2) dengan adanya mediator. Peroksidase ini bisa protein hem dan nonhaem. Pada mamalia, mereka yang terlibat dalam proses biologis seperti sistem kekebalan tubuh atau peraturan hormon. Pada tumbuhan, mereka terlibat dalam auksin metabolisme, lignin dan suberin formasi, silang komponen dinding sel, pertahanan terhadap patogen, atau sel elongasi [37, 38].
Para hemeperoxidases telah
diklasifikasikan ke dalam dua kelompok yang berbeda seperti yang ditemukan
hanya pada hewan dan
ditemukan dalam tanaman, jamur, dan prokariota. Para
peroksidase Kelompok kedua telah dibagi menjadi tiga
kelas berdasarkan urutan perbandingan. Kelas I adalah
enzim intraseluler termasuk ragi sitokrom
c peroksidase, peroksidase
askorbat (APX) dari
tanaman, dan bakteri gen-digandakan katalase
peroksidase. Kelas II terdiri dari peroksidase
jamur sekretorik seperti
lignin peroksidase (LiP) dan mangan
peroksidase (MNP) dari Phanerochaete chrysosporium,
dan Coprinus cinereus
peroksidase atau Arthromyces
ramosus peroksidase (ARP). Peran utama dari kelas II peroksidase
tampaknya menjadi degradasi lignin dalam kayu. Kelas
III berisi peroksidase
tanaman sekresi seperti
yang dari lobak (HRP), barley, atau kedelai.
Peroksidase ini tampaknya enzim biosintesis yang
terlibat dalam proses seperti pembentukan
dinding sel tanaman dan spesifikasi-ligni [37, 38].
Peroksidase Nonhaem tidak
evolusioner terkait dan bentuk lima keluarga independen. Mereka
adalah peroksidase thiol, alkylhydroperoxidase, haloperoxidase nonhaem, mangan katalase
dan NADH peroksidase.
Di antara semua ini peroksidase tiol adalah
yang terbesar dan memiliki dua
anak suku seperti peroksidase glutation dan
redoxins peroksi [38].
Peroksidase Nonhaem tidak
evolusioner terkait dan bentuk lima keluarga independen. Mereka
adalah peroksidase thiol, alkylhydroperoxidase, haloperoxidase nonhaem, mangan katalase
dan NADH peroksidase.
Di antara semua ini peroksidase tiol adalah
yang terbesar dan memiliki dua
anak suku seperti peroksidase glutation dan
redoxins peroksi [38]. (MNP), dan peroksidase
serbaguna (VP) telah
dipelajari paling karena potensi
tinggi untuk menurunkan zat-zat beracun di alam.
(1) Mikroba Lignin
Peroksidase. Peroksidase Lignin adalah metabolisme
sekunder. Di hadapan kosubstrat H2O2 dan
mediator seperti veratril
alkohol LIP mendegradasi
lignin dan senyawa fenolik
lainnya. Selama reaksi,
H2O2 akan dikurangi
menjadi H2O dengan memperoleh elektron dari
LIP, (yang dengan sendirinya akan teroksidasi). The
LIP (teroksidasi) dengan mendapatkan elektron
dari veratril alkohol kembali berkurang negara
asalnya, dan veratril
aldehida terbentuk. Veratril aldehida sekali
lagi akan berkurang kembali ke
veratril alkohol dengan
memperoleh elektron dari substrat. Hasil ini dalam
oksidasi senyawa fenolik terhalogenasi, senyawa aromatik
polisiklik dan senyawa aromatik lainnya diikuti oleh serangkaian reaksi nonenzimatik (Gambar 5) [40, 41]. Lignin peroksidase
(LiP) memainkan peran sentral dalam biodegradasi sel
tanaman lignin dinding
konstituen. LIP mampu
mengoksidasi senyawa aromatik dengan potensi
redoks yang lebih tinggi dari 1.4V (NHE) oleh abstraksi tunggal-elektron,
tetapi mekanisme redoks yang tepat masih kurang
dipahami [42].
(2) MicrobialManganesePeroxidases. Enzim heme MnPisanextracellular
dari lignin-merendahkan
Basidiomycetes jamur, yang mengoksidasi Mn2
+ ke oksidan
Mn3 + dalam
reaksi bertingkat. Mn2 + merangsang produksi MNP
dan berfungsi sebagai substrat untuk MNP. The
Mn3 +, yang
dihasilkan oleh MNP, bertindak
sebagai mediator untuk
oksidasi berbagai senyawa fenolik.
Dihasilkan Mn3 +
kelat oksalat yang
cukup kecil untuk berdifusi ke wilayah yang tidak terjangkau bahkan untuk enzim, seperti
dalam kasus lignin atau struktur
analog seperti polutan
xenobiotik (Gambar 6) yang terkubur di dalam tanah, yang belum tentu tersedia
untuk enzim [41].
(3) Mikroba serbaguna
Peroksidasa. VP enzim
dapat langsung mengoksidasi
Mn2 +, methoxybenzenes,
fenolik substrat aromatik
seperti itu dari MNP,
LIP, dan horseradish
peroksidase. VP memiliki luar biasa luas substrat
spesifik dan kecenderungan
untuk mengoksidasi substrat
dengan tidak adanya mangan bila dibandingkan dengan peroksidase lainnya. Hal ini juga
telah menunjukkan bahwa VP
mampu mengoksidasi baik fenolik dan
nonphenolic dimer Model lignin [43]. Oleh karena itu, sistem VP berlebih sangat
efisien diinginkan untuk aplikasi
bioteknologi dalam proses industri
dan bioremediasi polutan
bandel [27, 44].
4. Mikroba hidrolitik Enzim
Pencemaran tanah dan air dengan bahan kimia industri dan hidrokarbon minyak bumi adalah masalah serius dunia modern. Karena penggunaan luas mereka, mereka ditemukan sebagai kontaminan lingkungan di berbagai ekosistem air dan darat. Penggunaan teknologi bioremediasi untuk menghilangkan kotoran ini menyediakan alternatif yang aman dan ekonomi umum digunakan perlakuan fisik-kimia. Aktivitas bakteri adalah proses utama yang terlibat dalam hidrolisis polutan organik (Tabel 1). Aktivitas enzim ekstraseluler merupakan langkah kunci dalam degradasi dan pemanfaatan polimer organik, karena hanya senyawa dengan massa molekul yang lebih rendah dari 600 dalton dapat melewati pori-pori sel [46].
Pencemaran tanah dan air dengan bahan kimia industri dan hidrokarbon minyak bumi adalah masalah serius dunia modern. Karena penggunaan luas mereka, mereka ditemukan sebagai kontaminan lingkungan di berbagai ekosistem air dan darat. Penggunaan teknologi bioremediasi untuk menghilangkan kotoran ini menyediakan alternatif yang aman dan ekonomi umum digunakan perlakuan fisik-kimia. Aktivitas bakteri adalah proses utama yang terlibat dalam hidrolisis polutan organik (Tabel 1). Aktivitas enzim ekstraseluler merupakan langkah kunci dalam degradasi dan pemanfaatan polimer organik, karena hanya senyawa dengan massa molekul yang lebih rendah dari 600 dalton dapat melewati pori-pori sel [46].
Enzim hidrolitik mengganggu
ikatan kimia utama dalam molekul beracun dan
hasil dalam pengurangan toksisitas
mereka. Mekanisme ini berlaku efektif untuk biodegradasi tumpahan minyak dan organo
fosfat dan insektisida karbamat. Insektisida organoklorin
seperti DDT dan
heptaklor stabil dalam
tanah yang aerasi tapi mudah menurunkan
dalam lingkungan anaerobik
[12, 46, 47].
Hidrolase juga mengkatalisis
beberapa reaksi terkait termasuk kondensasi dan alkoholisis.
Keuntungan utama dari kelas enzim ini adalah
ity availabil- siap,
kurangnya selektivitas kofaktor stereo, dan
mentolerir penambahan pelarut air-larut.
Hidrolase milik kelompok 3 kelas enzim dan mungkin lebih
bisa diklasifikasikan sesuai dengan jenis obligasi dihidrolisis [48].
Enzim hidrolitik ekstraseluler seperti amilase,
protease, lipase, DNases, pullulanases, dan xilanase memiliki penggunaan
potensi yang cukup beragam di daerah yang berbeda seperti industri makanan,
aditif pakan, ilmu biomedis, dan industri kimia [49]. The hemiselulase,
selulase, dan glikosidase yang begitu penting karena penerapannya dalam
degradasi biomassa [39].
4.1. Lipase mikroba. Lipase menurunkan lipid yang
berasal dari berbagai macam mikroorganisme, hewan dan tumbuhan. Karya terbaru
menunjukkan bahwa lipase berkaitan erat dengan polutan organik yang ada di
dalam tanah. Aktivitas lipase bertanggung jawab atas drastis pengurangan jumlah
hidrokarbon dari tanah yang terkontaminasi. Penelitian yang dilakukan di daerah
ini
kemungkinan untuk kemajuan pengetahuan dalam bioremediasi
minyak tumpahan [50,
51]. Lipase telah
diekstraksi dari bakteri, tumbuhan, actinomycetes, dan sel hewan. Di
antaranya lipase mikroba lebih fleksibel karena aplikasi
potensial dalam industri.
Enzim ini dapat mengkatalisis
berbagai reaksi hidrolisis suchas, alkoholisis dan
aminolysis [52].
Lipase adalah enzim
di mana-mana yang mengkatalisis hidrolisis triasilgliserol menjadi gliserol dan asam lemak bebas. Reaksi lipolitik
terjadi pada antarmuka air lipid, di mana
substrat lipolitik biasanya membentuk keseimbangan
antara monomer, misel, dan negara-negara emulsi. Lipase telah diklasifikasikan
menjadi dua jenis berdasarkan kriteria seperti (a) peningkatan
aktivitas enzim segera setelah trigliserida membentuk emulsi dan (b) lipase dengan lingkaran protein
(tutup) yang mencakup di situs aktif [53
Trigliserida merupakan komponen utama minyak alami atau lemak.
Hal ini dapat menghidrolisis
berturut-turut untuk diasilgliserol, monoasilgliserol, gliserol, dan asam lemak. Gliserol dan asam lemak yang banyak digunakan sebagai bahan baku, misalnya,
monoasilgliserol digunakan sebagai agen pengemulsi dalam industri makanan, kosmetik, dan farmasi.
Penelitian ini dilakukan pada triolein hidrolisis dari
Candida rugosa lipase
dalam sistem minyak-air biphasic yang terbukti
efektif. Lipase adsorbsi pada antarmuka minyak-air
di sebagian besar fase air. Lipase kemudian
istirahat obligasi ester dari triolein untuk
menghasilkan
berturut-turut diolein, monoolein, dan gliserol. Selama katalis asam oleat terbentuk pada setiap tahap reaksi berturut-turut. Gliserol yang terbentuk adalah hidrofilik dan dengan demikian larut ke dalam fase air [36] (Gambar 7).
berturut-turut diolein, monoolein, dan gliserol. Selama katalis asam oleat terbentuk pada setiap tahap reaksi berturut-turut. Gliserol yang terbentuk adalah hidrofilik dan dengan demikian larut ke dalam fase air [36] (Gambar 7).
Aktivitas lipase ditemukan parameter indikator yang paling berguna untuk menguji degradasi hidrokarbon di dalam tanah [50, 51]. Lipase
adalah banyak menarik dalam produksi regiospe- ci fi c senyawa yang bekerja di
industri farmasi. Seiring dengan penggunaan diagnostik dalam bioremediasi, lipase
memiliki banyak aplikasi potensial
dalam makanan, chemi- kal, manufaktur deterjen,
kosmetik, dan industri pembuatan kertas, tetapi biaya produksinya telah membatasi penggunaan industri yang [53, 54].
4.2. Mikroba selulase.
Selulase sekarang menjanjikan suatu potensi untuk mengubah limbah bahan
selulosa menjadi makanan untuk memenuhi populasi yang berkembang dan telah
menjadi subjek penelitian intensif
[55]. Beberapa organisme
menghasilkan sel terikat,
amplop sel yang berhubungan, dan beberapa selulase ekstra
selular. Selulase ekstraselular,
hemicellulases, dan pectinases telah terbukti
secara konstitutif diekspresikan pada
tingkat yang sangat rendah oleh beberapa
bakteri dan jamur [56, 57].
Selulase biasanya campuran
dari beberapa enzim. Setidaknya:
tiga kelompok utama selulase yang terlibat
dalam proses hidrolisis (1)
endoglukanase (EG, glucanohydrolase endo 1,4-D) yang menyerang daerah
kristalinitas rendah selulosa,
menciptakan rantai gratis berakhir; (2) canase
exoglu- atau cellobiohydrolase
(CBH, 1,4-bD-glukan hidrolase cellobio-)
yang menurunkan molekul selulosa lebih lanjut dengan
menghapus unit selobiosa dari rantai ujung bebas;
(3) β- glukosidase
yang menghidrolisis selobiosa menjadi glukosa unit. Seiring dengan enzim
utama, beberapa enzim tambahan juga hadir. Selama
hidrolisis enzimatik, selulosa
terdegradasi oleh selulase untuk mengurangi gula (Gambar 8) yang dapat difermentasi oleh ragi atau bakteri untuk etanol [58].
terdegradasi oleh selulase untuk mengurangi gula (Gambar 8) yang dapat difermentasi oleh ragi atau bakteri untuk etanol [58].
Enzim selulase mampu
menurunkan kristal selulosa
menjadi glukosa. Selulase telah digunakan dalam pembuatan deterjen sejak awal
1990-an. Selulase menghilangkan mikro selulosa,
yang terbentuk selama mencuci dan penggunaan kain
berbahan kapas. Hal ini juga diamati sebagai cerah warna dan bahan pelunakan dalam industri tekstil. Selulase Alkaline diproduksi
oleh Bacillus strain dan selulase netral dan
asam oleh Trichoderma
dan Humicola jamur.
Dalam industri kertas dan pulp, selulase memiliki
telah bekerja untuk menghilangkan
tinta pada kertas
daur ulang. Para selulase
ditambahkan selama pembuatan bir untuk meningkatkan pembebasan jus dari daging buah dan
untuk produksi etanol dari biomassa selulosa [59].
4.3. Mikroba Protease. Protease menghidrolisis
pemecahan zat protein
yang memasuki atmosfer karena shedding dan
moulting pelengkap, kematian hewan, dan
juga sebagai produk sampingan dari beberapa industri seperti unggas, dan kulit.
Protease milik kelompok enzim yang menghidrolisis
ikatan peptida dalam lingkungan berair dan mensintesis
mereka dalam lingkungan berair. Protease memiliki
berbagai aplikasi dalam makanan, kulit, deterjen, dan
industri farmasi [60, 61].
Protease dibagi sebagai
endopeptidases dan exopeptidases dasar jangan
hecataly .Endopeptidases lanjut dikelompokkan berdasarkan
posisi situs aktif seperti
sebagai endopeptidase serin, sistein peptidase, peptidase endo aspartat, dan metallopeptidases. Enzim yang reaksi mekanisme tion benar-benar dijelaskan dikelompokkan dalam (Gambar 9). Para exopeptidases bertindak hanya dekat amino terminal atau posisi karboksilat rantai. Protease yang bekerja pada amino bebas, dan terminal karboksil disebut sebagai aminopeptidase dan Carboxypeptidase, masing-masing.
sebagai endopeptidase serin, sistein peptidase, peptidase endo aspartat, dan metallopeptidases. Enzim yang reaksi mekanisme tion benar-benar dijelaskan dikelompokkan dalam (Gambar 9). Para exopeptidases bertindak hanya dekat amino terminal atau posisi karboksilat rantai. Protease yang bekerja pada amino bebas, dan terminal karboksil disebut sebagai aminopeptidase dan Carboxypeptidase, masing-masing.
Endopeptidase yang bekerja
pada daerah bagian dalam rantai
peptida. Kehadiran amino bebas dan terminal
karboksil akan berdampak negatif terhadap aktivitas enzim [62].
Protease telah digunakan dalam pembuatan industri manufaktur keju dan deterjen sejak
bertahun-tahun. Protease alkalin
yang digunakan dalam industri kulit
untuk menghilangkan rambut dan bagian yang hadir pada
kulit hewan. Protease telah digunakan untuk produksi dipeptida aspartam, yang
merupakan noncalor stapel manis-ener. Dalam industri farmasi, yang bervariasi
dan spesifik protease yang digunakan dalam
mengembangkan agen terapi yang
efektif. Klostridial kolagenase
atau Subtilisin digunakan
dalam kombinasi dengan antibiotik
spektrum luas dalam pengobatan luka
bakar dan luka [63].

Komentar
Posting Komentar